Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Swt1Q9DBQ9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms