Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fundc1Q9DB70 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms