Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms