Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Scp2d1Q9DAH1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms