Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DA42 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DA42 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9DA42 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9DA42 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms