Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmbim4Q9DA39 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmbim4Q9DA39 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms