Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34b2Q9D9N2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms