Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Actrt1Q9D9J3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms