Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D9D9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D9D9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D9D9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D9D9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D9D9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D9D9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D9D9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D9D9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D9D9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms