Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y0

Efhd2, EF-hand domain-containing protein D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd2Q9D8Y0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efhd2Q9D8Y0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms