Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SlirpQ9D8T7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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