Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q9D8Q6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Q9D8Q6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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Q9D8Q6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9D8Q6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms