Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms