Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmigd1Q9D7L8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmigd1Q9D7L8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms