Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capns2Q9D7J7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Capns2Q9D7J7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms