Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F2

Lypd6b, Ly6/PLAUR domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lypd6bQ9D7F2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lypd6bQ9D7F2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lypd6bQ9D7F2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms