Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klhl40Q9D783 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klhl40Q9D783 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms