Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MsraQ9D6Y7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MsraQ9D6Y7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms