Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PudpQ9D5U5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms