Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lpcat2bQ9D5U0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lpcat2bQ9D5U0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lpcat2bQ9D5U0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms