Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn11Q9D572 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms