Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D4W2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D4W2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D4W2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D4W2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D4W2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D4W2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D4W2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D4W2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D4W2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D4W2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D4W2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D4W2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9D4W2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms