Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc83Q9D4V3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms