Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930556J24RikQ9D4U7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms