Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms