Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms