Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sohlh2Q9D489 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sohlh2Q9D489 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sohlh2Q9D489 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sohlh2Q9D489 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sohlh2Q9D489 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sohlh2Q9D489 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sohlh2Q9D489 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms