Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pus10Q9D3U0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms