Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsig1Q9D2J4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms