Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trappc6bQ9D289 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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