Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms