Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms