Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ift27Q9D0P8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ift27Q9D0P8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift27Q9D0P8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms