Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mdm1Q9D067 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms