Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Elp3Q9CZX0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms