Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Utp11Q9CZJ1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms