Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nde1Q9CZA6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms