Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Bud23Q9CY21 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Bud23Q9CY21 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Bud23Q9CY21 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bud23Q9CY21 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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