Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Xrcc3Q9CXE6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Xrcc3Q9CXE6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Xrcc3Q9CXE6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Xrcc3Q9CXE6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Xrcc3Q9CXE6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Xrcc3Q9CXE6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Xrcc3Q9CXE6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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