Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mgme1Q9CXC3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms