Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RpainQ9CWY9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RpainQ9CWY9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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