Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpusd4Q9CWX4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpusd4Q9CWX4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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