Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms