Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx28Q9CWT6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms