Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cnot11Q9CWN7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cnot11Q9CWN7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cnot11Q9CWN7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot11Q9CWN7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cnot11Q9CWN7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot11Q9CWN7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Cnot11Q9CWN7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot11Q9CWN7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Cnot11Q9CWN7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Cnot11Q9CWN7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot11Q9CWN7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot11Q9CWN7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot11Q9CWN7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot11Q9CWN7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot11Q9CWN7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot11Q9CWN7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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