Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NubplQ9CWD8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NubplQ9CWD8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms