Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms