Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ska2Q9CR46 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ska2Q9CR46 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms