Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms