Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PompQ9CQT5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PompQ9CQT5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms